常見的生物發酵罐分為固體發酵罐和液體發酵罐。發酵罐根據容積和用途不同，分為種子罐（菌種發酵罐）和發酵罐。發酵罐根據需氧類型的不同又分為通風式發酵罐和厭氧發酵罐。

一般發酵罐設備的高徑比為1.7-2.5之間，高徑比大有利于傳熱和溶氧，攪拌剪切力大。發酵罐的攪拌裝置包括機械攪拌和非機械攪拌。通風發酵的攪拌裝置包括電動機、傳動裝置、攪拌軸、軸密封裝置和攪拌槳。機械攪拌的目的是迅速分散氣泡和混合加入物料。